中心内设办公室、财务科、档室科、窗口服务科（含市民服务中心窗口）、人才交流科、人才服务科、信息技术科、中心党委、人才储备中心等科室，具体岗位职责如下：
1. 办公室：负责协助领导对业务等有关工作进行综合协调管理，拟定工作制度、工作计划并负责监督检查,负责汇总综合性材料、会议组织、公文审核、文电处理、机要档案、秘书事务、中心人事事务、12345等信访诉求回复、保卫及信息宣传、对外联络、后勤保障、固定资产管理等工作。
2. 财务科: 负责中心财务预决算、各类就业创业补贴资金财务管理、基金使用内部监督等财务相关工作。
3. 档案科：负责接收、审核、完善人事代理人员和档案寄存人员转入的人事档案，为符合相关规定的单位提供人事档案材料查（借）阅、政审等服务，目前正紧锣密鼓地开展档案电子化扫描工作。
4.窗口服务科（含市民服务中心窗口）：负责办理流动人员档案调入、调出手续，出具与档案有关的政审.存档等证明，负责人才集体户户籍申报及集体户的管理、非公组织各类人员职称申报和评定，为毕业生提供就业创业相关政策咨询及就业见习补贴、就业创业一次性生活补贴等补贴发放工作；贯彻人才储备政策并组织实施，负责储备人员的档案、户口、党组织关系等事项的综合管理，免费为储备人员提供人才供求信息、择业咨询指导、推荐就业、发放生活补助费等服务。
5. 人才交流科：负责各类用人单位及人才供求信息的征集和发布；组织开展公开招聘人才活动；负责区域及有关部门人才交流协作；协助做好人才储备和储备人才推荐工作；负责各个种类、各个层次的人才库的管理；组织开展海峡两岸社会实践活动；负责台湾青年实习、就业等相关服务工作。
6.人才服务科：负责毕业生求职创业补贴发放工作；负责“植根榕城”福州市优秀创业项目、创业孵化示范基地评选等创业政策的受理工作；负责牵头并指导各县（市）区一次性创业补贴、创业带动就业补贴、场租补贴、创业担保贷款等各类创业扶持政策的受理工作；协助完成人才共有产权住房、租房补贴、人才公寓等各类人才的住房保障政策受理工作。
7. 信息技术科：负责中心门户网站福州人事人才网、微信公众号中心相关模块的开发、维护、管理和升级，负责中心各类业务系统调研、维护与开发工作，承担各类网络信息发布工作。
8. 中心党委：负责各流动党支部及流动人才党员管理，包括组织关系转入（转出）、党费收缴、预备党员转正、党内年度统计及组织开展党日活动等中心党委的各项综合管理工作。
